Databáza poznatkov

Pilotné prípady použitia

Vedecké prípady použitia, ktoré poháňajú technickú integráciu uzla: AMR, MCVAL, RETROCHANGE a koncept SDGaaS.

Federatívna analýza patogénov (AMR)

Vedúci prípad použitia súvisiaci s výskumom antimikrobiálnej rezistencie. Postupná realizácia: technická realizovateľnosť na verejných datasetoch v slovensko-poľskom pilote, potom integrácia súkromných dát a napokon prijatie verejným zdravotníctvom pre monitorovanie patogénov v reálnom čase. Federatívny prístup uchováva citlivé dáta pod lokálnou kontrolou – výpočet beží na serveroch poskytovateľov dát a zdieľajú sa len spracované výsledky. Slovenský poskytovateľ Onedata bol prepojený s Onedata v uzle EOSC Poľsko a analytické workflow (AMR Watch, cgMLST outbreaks, respiratory, COVID lineage, wastewater) sú zverejnené ako open source.

Spolupráca na MCVAL

Účasť na multicentrickej validácii hodnotenia snímok skríningu rakoviny prostaty založeného na umelej inteligencii (MCVAL od BBMRI). Uzol zbiera a spracúva skríningové snímky (WSI) zo slovenských zdrojov, agreguje datasety a vytvára pipeline pre zdieľanie do modelu RationAI a distribúciu výsledkov medicínskym hodnotiteľom, v spolupráci s Lekárskou fakultou Univerzity Komenského.

RETROCHANGE

Retrospektívna analýza zmien lesa a krajiny z historických satelitných snímok Technickej univerzity vo Zvolene: balík odtajnených snímok Slovenska z éry družíc CORONA/HEXAGON (približne 1960–1985) pripravený pre EOSC, spracovaný do geopriestorových produktov a predvedený cez reprodukovateľné Jupyter workflow. Portál: gis.tuzvo.sk/retrochange .

Federatívne SDGaaS (koncept)

Generovanie syntetických datasetov ako služba – myšlienka pre budúce použitie: ak vhodný dataset neexistuje, vytvoriť syntetický v rámci EOSC. Zatiaľ v štádiu konceptu.

Prototypové záznamy služieb k týmto prípadom použitia sú zaregistrované v katalógu služieb na sc.eosc.sk.

Zdroje a ďalšie čítanie